PMA heeft een beloningsbeleid. PMA betaalt leden van het bestuur en de raad van toezicht uitsluitend vaste vergoedingen en geen variabele beloningen. Deze vergoeding is gebaseerd op de verantwoordelijkheid, functie-eisen en tijd die een lid geacht wordt aan het fonds te besteden. Structurele loonsverhogingen in procenten conform de Cao Apotheken worden in principe gevolgd.
Voor leden van het verantwoordingsorgaan wordt het SER-systeem gevolgd, wat inhoudt dat vacatievergoedingen worden uitbetaald op basis van het bijwonen en duur van vergaderingen.
De medewerkers van het bestuursbureau van PMA hebben een eigen arbeidsvoorwaardenregeling. Wijzigingen in de Cao voor het Verzekeringsbedrijf worden in principe gevolgd. Loonsverhogingen conform deze cao worden overgenomen. Er is geen sprake van variabele beloningen voor de medewerkers van het bestuursbureau.